小规模纳税人在缴纳增值税时，有两种税收会计制度可供选择：收入总额征收增值税会计制度和进销项发票制度。
首先，收入总额征收增值税会计制度要求小规模纳税人在每月缴纳增值税时，需要在规定的增值税申报表内报送收入总额和当月销售额。根据公式换算出当月的增值税，即可完成增值税缴纳。这种制度适用于那些没有购销发票或者购销发票不完整的小规模纳税人。
其次，进销项发票制度要求小规模纳税人在缴纳增值税时，需要发票作为增值税的核算凭证。每月结账时，需要填写购销发票，把本月销售发票分类归档，产生增值税发票，根据发票征收增值税，完成增值税的按期缴纳。这种制度适用于那些有购销发票并且购销发票完整的小规模纳税人。
此外，对于采用收入总额会计制度缴纳增值税的小规模纳税人来说，他们需要向税务机关提供收入及支出的核算凭证。也就是说，在缴纳增值税时，除了购销发票外，还需要统计与收入相关的所有费用，以准确申报增值税。
总之，小规模纳税人在缴纳增值税时可以根据自己实际情况选择适合的税收会计制度。无论选择哪种制度，都需要按照相关法规进行操作，确保按时足额缴纳增值税。