公司之间的往来款是指两家公司之间的资金往来，是以记账的方式来进行的。一般的做账方式如下：
1. 记账凭证：登记双方的收支明细，备注具体的交易事项，准备供审计时使用。
2. 会计分录：根据记账凭证，分别用借贷原则，进行记账，登记往来款的收支，并在两个账户上登记，方便验账。
3. 现金流量表：根据记账凭证登记公司与公司之间收支情况，维护公司的财务状况。
4. 结账：根据现金流量表，结账时登记款项的实收或实付，把结账的结果记录在账户上，用作分析。
拓展知识：企业之间往来款的报销需要遵守一定的程序。一般来说，报销的流程分为申请、审核、领款、报销到账等几个环节，每个环节都要登记双方的收支明细，或者作记录或者作证，以免款项失踪。